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研究利用Evo进行从分子到基因组规模的序列建模和设计—小柯机器人—科学网
发布:2024-11-19 10:05:57 浏览:

  美国加州Arc研究所Brian L. Hie和Patrick D. Hsu合作,近期取得重要工作进展。他们研究提出利用Evo进行从分子到基因组规模的序列建模和设计。相关研究成果2024年11月15日在线发表于《科学》杂志上。

  据介绍,基因组是一种能编码DNA、RNA和蛋白质的序列,这些序列协调了生物体的功能。

  研究人员推出了Evo,一种具有前沿架构的长上下文基因组基础模型,训练数据覆盖了数百万个原核生物和噬菌体基因组,并报告了DNA的扩展规律,以补充语言和视觉领域的观察结果。Evo能够在DNA、RNA和蛋白质之间实现泛化,具备零样本功能预测能力,其表现可与领域专用语言模型媲美。

  此外,它能够生成功能性CR星空体育官方入口 星空体育官网ISPR-Cas和转座子系统,代表了语言模型在蛋白质-RNA和蛋白质-DNA协同设计中的首个示例。Evo还能够学习小突变如何影响整个生物体的适应性,并生成具有合理基因组结构的百万碱基规模序列。

  总之,Evo的预测和生成能力跨越了分子到基因组的复杂性尺度,推动了人们对生物学的理解和控制能力的进步。