科学家使用SCOPE实现细胞外囊泡mRNA的突变分析—小柯机器人—科学网
美国麻省总医院Hakho Lee等研究人员合作使用SCOPE实现细胞外囊泡mRNA的突变分析。该项研究成果于2024年10月7日在线发表在《自然生物技术》杂志上。
研究人员表示,液体活检中细胞外囊泡(EV)中的信使RNA(mRNA)测序可以提供临床信息,如体细胞突变、耐药性谱和肿瘤复发。尽管如此,由于其在液体活检中的低丰度,EV mRNA仍未得到充分利用,且需要大样本体积或专门的分析技术。
研究人员介绍了一种用于EV mRNA检测的平台自放大和CRISPR辅助操作以分析EV(SCOPE)。SCOPE利用CRISPR介导的目标RNA识别,通过Cas13启动复制和信号放大,达到亚阿摩尔检测限,同时保持单核苷酸分辨率。
作为概念验证,研究人员设计了针对KRAS、BRA星空体育网站 星空体育首页F、EGFR和IDH1基因关键突变的探针,优化了单锅检测的协议,并实现了多样本检测的自动化设备。研究人员验证了SCOPE在动物模型中检测早期肺癌的能力,监测了结直肠癌患者的肿瘤突变负担,并对胶质母细胞瘤患者进行了分层。SCOPE可以加快结果读取,增强EV在精准肿瘤学中的临床应用。
