也有多地相继发布关于开展基孔肯雅热和登革热免费检测的相关通知，如荆州的石首市、江陵县、监利市，襄阳的星空体育 星空体育平台南漳县，十堰市的竹溪县，等等。
核酸检测、病毒分离、血清抗体检测等，均为基孔肯雅热的重要诊断方法。当前基孔肯雅热疫情虽已得到一定的控制，但近期跨区域人员流动量大，并且仍有新发疫点出现，检验人自然可能会需要参与到诊断工作之中。
7月31日，国家卫生健康委办公厅与国家中医药局综合司联合印发了《关于印发基孔肯雅热诊疗方案（2025年版）的通知》，详细制定了基孔肯雅热最新的诊断和治疗方案。
而就在诊疗方案印发的前两日，也就是7月29日，全国基孔肯雅热疫情防治工作电视电话会议在北京召开，会上对疫情防控作出了部署，强调要加强医疗卫生机构检验检测质控，并提高“早发现”能力。
并且在7月25日，国家卫生健康委临床检验中心就曾发布紧急通知，鉴于本轮基孔肯雅热疫情持续升级，宣布面向全国实验室增开一次“新发再发经血传播蚊媒病原体监测以及室间质量评价活动。
无需因核酸检测的普遍开展而太过的焦虑。检测的核心目的是及时发现感染者，以便进行医疗干预和疫情监测，工作量可能有一时的增加，但基本上是短期且在能力范围内的。
登革热与基孔肯雅热的传播媒介相同，流行区域基本相同，临床表现类似，较难鉴别，且可存在合并感染的情况。登革热发热多为中高热，持续时间更长，肌肉痛、腹部症状（腹痛、腹胀、便秘等）更明显，有出血倾向，外周血白细胞和血小板减少明显，红细胞压积、ALT或AST常增高，重症较基孔肯雅热多见，可出现休克、脑病、多器官功能障碍等并发症。而基孔肯雅热多为中低热，关节疼痛明显，可为首发症状，多累及远端小关节，外周血白细胞、血小板基本正常，重症少见。需核酸检测鉴别。在登革热流行高风险区，建议也对登革热进行检测。