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怎么通过Q-PCR的扩增曲线和溶解曲线来分析结果如何通过来判断结果的好与坏?-星空体育官方网站
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怎么通过Q-PCR的扩增曲线和溶解曲线来分析结果如何通过来判断结果的好与坏?
发布:2025-07-18 11:27:59 浏览:

  (1)扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);

  (2)同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。当然这是理论值;另外阴性对照不能有扩增(40个循环以后出CT值属正常现象,也可算作没有扩增)。

  2、溶解曲线)溶解曲线是判断扩增产物是星空体育网站 星空体育首页否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线)一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间;

  (3)出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因所致;

  (4)基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。

  3、溶解曲线是为了验证扩增产物特异性的,要是溶解曲线是单峰说明产物只有一条,结果较好;要是双峰说明产物不特异,可能存在引物二聚体或非特异性扩增,有可能引物设计有问题。

  溶解曲线、可以用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物。2、扩增反应完成后,通过逐渐增加温度同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低。

  3、用荧光信号星空体育网站 星空体育首页改变的负的一次导数与温度作图,在扩增产物的溶解温度上有一特征峰(Tm,DNA双链解链50%的温度),用这个特征峰就可以将特异产物与其它产物如引物二聚体区分开,

  4、溶解曲线是为了观察扩增发出荧光的片段是不是需要的产物。如果溶解曲线做出来只有单峰,且出锋位置是退火温度,那么这个是产物发出的荧光,实验结果有效。

怎么通过Q-PCR的扩增曲线和溶解曲线来分析结果如何通过来判断结果的好与坏?(图1)

怎么通过Q-PCR的扩增曲线和溶解曲线来分析结果如何通过来判断结果的好与坏?(图2)

  1、扩增曲线:一般来说如果你做双ΔCT法那么你的扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。比如同一种CDNA5倍浓度稀释,那么同一种基因扩增的前提下,5倍浓度模板的CT值会比1倍浓度模板的CT值提前2.3个循环左右,以此类推,当然这是理论值;另外阴性对照不能有扩增(40个循环以后出CT值属正常现象,也可算作没有扩增)。2、溶解曲线:溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因(也有可能是从加完反应液到上机开始PCR这之间的时间过长)所致;基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。