仅需2步做出强迫症都满意的qPCR曲线
最近常常在实验室看见闷头处理数据的小师妹,原本朝气蓬勃的小美眉,这几天跟霜打了的茄子一样。
小师妹碰到的引物二聚体问题是 QPCR 实验中最常见的问题之一。其原因是引物对之间的部分序列存在同源性。
可以用熔解曲线(又称解离曲线)和凝胶电泳来完成。熔解曲线,是结合染料的双链DNA 解离或“熔解”成单链 DNA
如果扩增特异性良好,则解离曲线将出现一个较窄的单峰。而引物二聚体的荧光强度较低,呈较宽较低的“波形”(见师妹熔解曲线°C 左右
其他的试剂按比例正常加入,用于监测反应体系中的污染。正常情况下,NTC 孔中不会有扩增。当NTC 孔出现扩增时,则预示体系中可能有污染。(扩增曲线:图来自real-time PCR handbook from ThermoFisher
首先,最好在引物设计阶段就能采取简单的预防措施,从一开始即避免二聚体的形成。有许多方法可以减少或消除反应中的引物二聚体.
听了师姐的讲解你还是担心做不好,毕竟还有那么多坑呢,常见的不常见的,简直「坑死了。」
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