CRISPR/Cas9文库筛选技术可实现全基因组范围的高通量筛选,其针对每个基因设计3-10条sgRNA,利用芯片一次性合成数万条覆盖整个基因组的sgRNA探针,通过克隆构建载体库,经慢病毒包装后以低感染复数感染宿主细胞,使得理论上每个细胞整合一条sgRNA,构建获得覆盖全基因组的基因敲除细胞池;经过筛选后,提取基因组并针对整合的sgRNA序列进行高通量测序,分析筛选前后sgRNA的丰度变化,进而找出其对应候选基因。
根据 MOI 的测定方法,感染文库病毒,为了确保大多数细胞只被编辑一种基因,选择M0I≤0.3 对应的病毒量感染细胞,并且使得每条 sgRNA 平均有 500 个以上的细胞表达。例如,可成药靶点 CRISPR/Cas9 敲除型文库共有 4652 条 sgRNA,按照 MOI=0.3,sgRNA 覆盖率为 500×,大约需要感染 7.8×10^6 个细胞。
(1)取对数生长期的细胞进行消化,将消化好的细胞用计数仪进行细胞计数,以 1×10^6 个细胞的密度接种到 6 孔板中,接种细胞的同时,计算 MOI=0.3 时需要的文库病毒液,病毒与细胞同时加入孔板中,每孔 2 mL 完全培养基,含 8 µg/mL polybrene,另铺一个不加病毒的作为对照;
胰酶进行消化,在培养箱孵育 3 min 以解离细胞,添加 1 mL 培养基终止消化;
(5)72 h后,未感染病毒的细胞全部死亡,感染病毒的细胞大概有 30%左右,此时给感染病毒的细胞换成新鲜培养液;
(6)扩增细胞,待细胞扩增到一定程度,以文库sgRNA的1000×细胞数进行保种冻存。一部分细胞收细胞团用作day0质控(用于提取基因组,细胞数为文库sgRNA的500×),一部分细胞用作筛选(细胞数为文库sgRNA的500×),筛选分为对照组和实验组,对照组加DMSO,实验组加合适浓度的药物(药物浓度需根据药物IC50曲线或IC80与实际筛选10cm或者15cmdish之间的差异,可以通过预实验进行测试,根据经验大皿中因为细胞数的增加导星空体育登录入口 星空体育在线官网致IC50或IC80浓度改变)。
海星生物一站式CRISPR文库筛选方案—文库质粒、文库病毒、文库扩繁、sgRNA文库定制、CRISPR文库筛选全套定制服务。
我们的服务:CRISPR/Cas9细胞基因编辑、载体构建/病毒包装、分子诊断标准品/突变基因标准品/融合基因标准品、细胞稳转/细胞干扰
我们的产品:HyCyte干细胞/原代细胞/细胞株、三系诱导培养试剂、细胞专用培养基、基因编辑试盒、病毒现货、预筛选胎牛血清
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近年来,伴随国家安全教育的不断深入,全民维护国家安全意识不断增强,越来越多的快递从业人员能够关注辨别禁寄物品、可疑人员,积极向国家安全机关反映,为及时遏止非法寄递,有效维护国家安全发挥了积极作用。
违规设立“小金库”,攀枝花市第十二中学校原党支部书记、校长胡常波被开除党籍和公职
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