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科学家使用先导编辑对耐药基因变异进行饱和分析—小柯机器人—科学网
发布:2024-11-17 16:03:35 浏览:

  韩国延世大学医学院Hyongbum Henry Kim团队,使用先导编辑对耐药基因变异进行饱和分析。2024年11月12日,《自然生物技术》杂志在线发表了这项成果。

  研究人员介绍了PEER-seq,这是一种基于先导编辑的高通量方法,可评估单核苷酸变异(SNV)的功能效应。PEER-seq使用先导编辑引入预定的SNV和同义标记突变,并通过深度测序内源性靶向区域,识别引入的SNV。

  研究人员在表皮生长因子受体基因(EGFR)中生成并功能性评估了2476个SNV,涵盖了典型酪氨酸激酶结构域中99%的所有可能变异。

  研究人员在PC-9细胞中测定了在共存替代突变T790M存在的情况下,95%所有可能的E星空体育网站 星空体育首页GFR蛋白变异体,对常见酪氨酸激酶抑制剂(阿法替尼、奥希替尼和厄洛替尼)的耐药性谱。该研究有潜力显著提高临床治疗选择的精准度。

  据了解,用于表征不确定意义基因变异(VUS)功能效应的方法,因突变空间的覆盖不完全而受到限制。在临床肿瘤学中,VUS引起的药物耐药性可能妨碍最佳治疗的实施。